翡翠的好坏除了种水底色工之外，还有一个重要的影响因素就是瑕疵的存在，说到瑕疵，如果是影响其牢固性的裂痕确实值得考虑，但是对于其他仅仅是影响美观度的瑕疵我们应该深入了解。
翡翠的肌理——棉
翡翠是一种纤维交织状的结构的多晶质集合体，它所包含的硬玉矿物在光线下会有白色的反光现象，我们把这个叫做翠性，也俗称苍蝇翅。当这些微小反光面聚在一起就会在肉眼中呈现出点状或者线状的白色棉絮状形态，我们称之为棉。换句话说，棉就是翡翠结晶颗粒的边界线。这是翡翠独有的特性。
可以这么说，再好的翡翠都是有棉的，只是肉眼的可见程度不一样。结晶颗粒越粗的棉也就越明显，还有透明度也是关键因素，越是透明的我们就越看得到棉，如果完全不透的我们肉眼看起来就看不见棉了。所以棉并不影响翡翠的价值。
棉在佩戴过程中，随着人体油脂汗水渐渐渗透到这些边界中间改变其折射方向，在肉眼中看起来就会变得不是那么明显。由于棉本身的形态和密集程度不一样，于是又有了死棉活棉的说法，其实只是区别棉可见度降低所需时间长短，并不是说死棉就不会散，活棉就会散。棉的消散是一个非常漫长的过程，需要大家正视这个问题。如果指望能把完全不透明的戴成玻璃种的话，估计即使世代相传也难以达成了。
翡翠的疤痕——石纹
翡翠在它的形成过程中经历了无数次的地质运动，无数次的挤压、碰撞、拉扯导致翡翠本身的结晶遭到破坏，形成了裂痕。一部分裂痕随着时间的沉淀渐渐愈合，恢复原有的牢固性，但是却留下疤痕，这就是愈合裂隙，我们俗称的石纹。
石纹也是翡翠中极其常见的现象，行内也称十玉九纹。在天然的毛料里几乎每一块完整的毛料里都有石纹。在这里不得不说雕刻师的心灵手巧，他们用智慧和巧手避开裂纹，尽量减少石纹，所以我们现在所见的翡翠成品中石纹已经是无法避免，所剩不多的了。
疤痕确实影响美观，但是它并不是翡翠的致命伤，石纹其实并不影响翡翠的牢固性。很多人误以为石纹处很容易断裂，其实在翡翠雕刻的抛光过程中它已经经历了钻头每秒几千转带来的剧烈震荡，如果真是不堪一击的话在雕刻过程中已经断裂。如果受到强烈撞击，即使没有石纹的依然会断裂，如果不受到强烈撞击，有石纹也不会断裂。
翡翠的血管——色根
在翡翠成矿中会有次生色侵入晶格形成漂亮的颜色。如果是进入晶格之间距离较大的部分，就会形成颜色较深的脉状形态就是色根。色根大多数呈褐黄色，墨绿色甚至接近黑色。在一部分成品中看起来有些影响美观，但其实只是有色元素聚集的位置。有说法说翡翠会越戴越绿，就是源自于色根中的铬离子会渐渐渗透在晶格间隙之中，并不是说白的翡翠可以戴成绿色。不过这个过程比起棉的消散还要漫长得多。
翡翠的痣——杂质
如果是次生矿物侵入愈合裂隙的话，就会看见点状的黑色物质，这些物质大多是二价铁或者三价铁的化合物，其实杂质中的铁元素对人体是很有好处的。虽然可能影响美观，但其实有较好的保健作用。
翡翠的灵性表现在于它的独一无二，也体现在这些与人体有极为相似的地方，人无完人，玉无完玉，正视所谓的瑕疵是非常有必要的。只有正视这些才能更好的认识玉石，才能选出最合适自己的宝玉。
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